鸟枪法蛋白质组学（Shotgun Proteomics），又称“底物蛋白质组学”或“全蛋白组分析”，是当前生命科学研究中最广泛应用的一种蛋白质组学策略。该方法通过高分辨质谱技术对复杂样本中的蛋白质进行整体识别与定量，不依赖抗体、无须预设靶标，极大拓展了蛋白组学的应用边界。

鸟枪法蛋白质组学的基本流程

鸟枪法蛋白质组学以“先消化、后分析”为基本流程。样本中的总蛋白首先经过酶解为肽段，然后通过液相色谱分离，再由质谱进行检测与分析。与靶向蛋白质组学不同，该方法不依赖预设的蛋白信息，可实现对全蛋白质组的无偏探索，适合于新机制研究、生物标志物发现、疾病机制解析等多种科研场景。

核心优势一：高通量识别，全面覆盖复杂样本

鸟枪法的最大亮点在于其出色的通量与覆盖率。现代高分辨质谱仪可在一次实验中识别数千到上万种蛋白，尤其适用于组织样本、体液样本、细胞系等背景复杂的生物体系。此外，结合深度分离策略（如多维液相色谱）与增强型数据库搜索算法，可以显著提高低丰度蛋白和膜蛋白等“难测组分”的识别能力。

核心优势二：无偏探索，助力新机制发现

鸟枪法天然具备无靶标、无假设的特点，适合于进行探索性研究。例如，在疾病模型中通过鸟枪法可系统比对不同状态下的蛋白表达差异，从而发掘潜在的通路变化或关键调控因子。这种数据驱动的研究模式为靶点发现和新机制验证提供了强大支持。同时，鸟枪法生成的数据兼容下游多组学整合分析，如与转录组、代谢组、磷酸化组数据进行交叉验证，增强了生物学解释的深度与广度。

核心优势三：定量精准，适应多样化研究需求

得益于稳定同位素标记（如TMT、SILAC）与标签自由定量（Label-free）的成熟策略，鸟枪法不仅可以定性识别蛋白，还可实现对蛋白表达量的相对或绝对定量。

• 标签定量（如TMT）适合多组样本同时分析，批间差小，数据一致性高
• Label-free方法适合样本量有限或样本难以标记的情况，灵活性强

这些定量策略支持差异蛋白筛选、动态变化监测和功能富集分析，为药物作用机制研究、干预手段评价等方向提供了坚实的数据基础。

核心优势四：技术成熟，易于标准化与规模化

当前鸟枪法蛋白质组学已形成高度标准化的实验流程与分析体系。从样本制备、蛋白酶解到质谱参数设定和数据质控，均可实现流程化操作，显著降低了实验重复性差异。在数据分析层面，多种成熟软件与数据库可用于肽段匹配、蛋白注释与生物通路富集，便于不同实验间的数据整合和跨项目比较。此外，质谱原始数据可长期留存与重分析，具备良好的数据可追溯性。

核心优势五：应用场景广泛，连接基础研究与转化医学

鸟枪法蛋白质组学的应用领域不断拓展，不仅服务于基础生物学研究，也日益渗透到临床转化和生物制药等应用方向：

• 疾病机制研究：系统描绘病变相关蛋白表达图谱，辅助疾病分型与预测模型建立
• 生物标志物发现：识别潜在的诊断、预后或治疗应答标志物
• 药物靶点筛选与作用机制研究：揭示候选药物干预下的蛋白网络响应
• 疫苗与抗体开发：分析免疫应答特异性蛋白表达变化
• 合成生物学与微生物代谢工程：辅助理解和优化目标菌株的蛋白表达调控

鸟枪法蛋白质组学凭借其全面、无偏、高通量的技术特性，已成为现代生命科学研究的中坚力量。它不仅为基础科研提供全景式数据支撑，也在精准医疗与生物技术产业中展现出巨大潜力。百泰派克生物科技不断整合前沿质谱平台与优化实验流程，致力于提供高深度、高准确性、高重复性的鸟枪法蛋白质组学服务。如您有蛋白质组研究需求，欢迎联系我们，获取高质量、定制化的技术解决方案！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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